Dr. Ricardo Cabrera
Grado:
Doctor en Biología Celular, Molecular y Neurociencias, Universidad de Chile, 2004
Tema de investigación o interés:
A pesar de su semejanza estructural, NAD y NADP participan en procesos bioquímicos muy distintos. En el metabolismo heterotrófico, mientras que NAD está implicado en el transporte de electrones hacia la cadena respiratoria, NADP generalmente participa de la transferencia de electrones hacia procesos biosintéticos. En general, las deshidrogenasas son selectivas hacia el uso de uno u otro cofactor aunque se han documentado deshidrogenasas que pueden usar ambos cofactores. En E. coli, la glucosa-6P deshidrogenasa, la primera deshidrogenasa de la vía de las pentosas, es considerada una de las principales fuentes de producción de NADPH. En mi grupo de investigación estudiamos los mecanismos mediante los cuales se establecen las concentraciones intracelulares de los cofactores reducidos. Nuestra estrategia consiste en modificar la selectividad por NADP o NAD en deshidrogenasas del metabolismo central y estudiar su efecto sobre el flujo de carbono y otros rasgos de la fisiología metabólica de la bacteria. Con este propósito estudiamos los determinates estructurales de la selectividad por NADP en la glucosa-6-P deshidrogenasa de E. coli, mediante mutagénesis sitio dirigida y caracterización por cinética enzimática. El incremento del número de reacciones que producen NADH en el metabolismo de E. coli tiene el potencial de aplicarse con el propósito de favorecer procesos de producción que dependen de una mayor disponibilidad intracelular de este compuesto.
Distinciones y premiaciones:
- Reconocimiento por "Destacada Labor Científica Año 2008". 44º Aniversario Facultad de Ciencias, Enero 2009.
Proyectos:
•METABOLIC EFFECTS OF AN ENGINEERED GLUCOSE-6-P DEHYDROGENASE WITH REVERSED NADP-NAD COFACTOR SPECIFICITY.
Proyecto Fondecyt 11080290
Investigador Responsable.
•A COMPREHENSIVE MODEL FOR THE MECHANISM OF ALLOSTERIC REGULATION OF E. COLI PHOSPHOFRUCTOKINASE-2. INTEGRATION OF KINETIC, STRUCTURAL, DYNAMIC AND MECHANIC ASPECTS.
Proyecto Fondecyt 1090336
Co-investigador.
Investigador Responsable: Dr. Jorge Babul
Publicaciones:
•Cabrera, R., Ambrosio, A. L., Garratt, R. C., Guixé, V. y Babul, J. Crystallographic Structure of Phosphofructokinase-2 from Escherichia coli in complex with two ATP Molecules. Implications for Substrate Inhibition. J Mol Biol 383, 588-602 (2008).
•Baez, M., Cabrera, R., Guixé, V. y Babul, J. Unfolding pathway of the dimeric and tetrameric forms of phosphofructokinase-2 from Escherichia coli. Biochemistry 46, 6141-6148 (2007).
•Parducci, R. E., Cabrera, R., Baez, M. y Guixé, V. Evidence for a catalytic Mg2+ ion and effect of phosphate on the activity of Escherichia coli phosphofructokinase-2: regulatory properties of a ribokinase family member. Biochemistry 45, 9291-9299 (2006).
•Cabrera, R., Caniuguir, A., Ambrosio, A. L., Guixé, V., Garratt, R. C. y Babul, J. Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the tetrameric form of phosphofructokinase-2 from Escherichia coli, a member of the ribokinase family. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 62, 935-937 (2006).
•Caniuguir, A., Cabrera, R., Baez, M., Vasquez, C. C., Babul, J. y Guixé, V. Role of Cys-295 on subunit interactions and allosteric regulation of phosphofructokinase-2 from Escherichia coli. FEBS Lett 579, 2313-2318 (2005).