Grado:

Doctor en Ciencias Biológicas con Mención en Microbiología

Tema de investigación o interés:

Mi tema de investigación fundamental trata sobre el estudio de los polifosfatos inorgánicos (poliPs) principalmente en bacterias. La carencia de este polímero de fosfato en las bacterias causan pleiotrópicos defectos tanto funcionales como estructurales los que afectan a los procesos patogénicos y la sobrevicencia en condiciones de carencia y estrés. Teniendo en cuenta la importancia de este biopolímero y lo variado de sus funciones, estudiamos la carencia de los poliP en los modelos bacterianos Escherichia coli y Pseudomonas aeruginosa desde una perspectiva global (genómica funcional y proteómica). Estas metodologías no solo nos permiten tener una visión general de las consecuencias de la carencia de los poliP en la célula sino también conocer los ajustes metabólicos que realizan las bacterias para para enfrentar dicha carencia. Con los resultados obtenidos mediante estas tecnologías OMICS y mediante herramientas bioinformáticas generamos redes de interacción que nos permitan elaborar nuevas hipótesis biológicas para decifrar las funciones y los actores moleculares relacionados con el metabolismo de los poliP en las bacterias.

Research Interest:

My principal investigation is about the study of inorganic polyphosphates (polyPs) in bacteria. The absent of this phosphate polymer in bacteria causes several functional and structural defects and affect important pathogenic processes and survival in conditions of deprivation and stress. Considering the importance of this biopolymer and its pleitropic functions, we studied the polyP deficiency in bacterial models such as Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa from a global perspective (functional genomic and proteomic). These methodologies not only allow us to have a global view of the consequences of polyP deficiency in the cell but also to know the metabolic adjustments that occur in the bacteria to face this deficiency. With the results obtained by OMICS technologies and by using bioinformatic tools we generated interaction networks that allow us to elaborate new biological hypotheses about the functions and the molecular actors related to polyP metabolism in the bacteria.

Distinciones y premiaciones:

• Medalla Herman Niemeyer 2005 otorgada por la Sociedad de Bioquímica y Biología al mejor estudiante de doctorado.
• Miembro de la Sociedad Chilena de Microbiología.
• Miembro de la Sociedad Chilena de Bioquímica y Biología Molecular de Chile.

Proyectos:

• Estudio de los determinantes de resistencia al cobre en bacterias y arqueas ambientales de uso en biominería y biorremediación. (FONDECYT Investigador responsable: Prof. Carlos A. Jerez G. Co-investigador: Prof. Francisco Chavéz Duración: 2007 - 2010)

• Genómica funcional y proteómica de bacterias deficientes en los niveles de polifosfatos inorgánicos (poliP). (FONDECYT Investigador responsable: Prof. Francisco Chávez Duración: 2007 - 2010).

Publicaciones:

• Basabe, L., Domínguez, I. and Chávez FP. Cloning and sequence analysis of the Candida utilis HIS3 gene. Biomol. Eng. (2004) 21:15-20.
• Chávez, F., Lünsdorf, H. and Jerez, C.A. Growth of polychlorinated biphenyl (PCB)-degrading bacteria in the presence of biphenyl and chlorobiphenyls generates oxidative stress and massive accumulation of inorganic polyphosphate. Appl. Environ. Microbiol. (2004) 70:3064-3072.
• Chávez, F.P., Gordillo, F. and Jerez, C.A. Adaptive responses and cellular behaviour of biphenyl-degrading bacteria toward polychlorinated biphenyls. Biotechnol. Adv. (2006) 24: 309-320.
• Gordillo, F., Chávez, F.P. and Jerez C.A. Motility and chemotaxis of Pseudomonas sp. B4 towards polychlorobiphenyls and chlorobenzoates. FEMS Microbiol. Ecol. (2007) 60: 322-328.
• Chávez FP, Mauriaca C, Jerez CA. Constitutive and regulated broad host range vectors for construction of polyphosphate deficient bacteria. BMC Res Notes. (2009) 2(1):50. -
• Varela C, Mauriaca C, Paradela A, Albar JP, Jerez CA, Chávez FP. New structural and functional defects in polyphosphate deficient bacteria: A cellular and proteomic study. (2009). Enviado a BMC Microbiol.

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